В «Векторе» обучили ИИ подбирать терапию ВИЧ по российским штаммам

Сотрудники центра вирусологии «Вектор» представили модели машинного обучения, которые оценивают тропность штаммов ВИЧ-1, то есть их способность поражать определённые типы клеток. От этого параметра зависит выбор препарата и скорость развития заболевания. Об этом пишет издание Ferra.

Как отмечает ТАСС, сейчас точно определить тропность можно только в лаборатории с использованием живого вируса. Такой подход дорог и доступен немногим учреждениям. Генотипические методы дешевле и быстрее, но существующие программы не рассчитаны на варианты вируса, характерные для России.

Разработчики обучили собственные алгоритмы на 13 тысячах последовательностей. Часть материала исследовали сами, остальное взяли из открытой базы данных. В итоге точность для одного российского варианта выросла примерно на 10%, а для другого достигла 90% на данных, которые модель ранее не видела.

Инструмент впервые протестирован именно на российских штаммах и получил графический интерфейс. В перспективе им смогут пользоваться врачи. Исследователи пояснили, что ранее подобного никто не делал: не хватало генотипированных последовательностей, а у зарубежных коллег не было интереса к этой задаче.